ルビを振りたい（`luatexja-ruby`）

\ltjruby{素粒子}{そ|りゅう|し}
\ruby{素粒子}{そ|りゅう|し}

ルビ用パッケージはいろいろあるようですが、luatexja-rubyを使えばよいと思います。 \rubyコマンドが別パッケージで使われていない場合に限り、\ltjrubyコマンドのエイリアスとして使用できます。

リファレンス